科普报道
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【科普报道】"后AlphaFold时代"的蛋白质折叠问题
如今，以AlphaFold为代表的使用深度学习人工智能（ AI ）的蛋白质结构预测方法，可以于几秒钟内完成在原子分辨率的蛋白质结构预测[ 1 ] 。AI从已知蛋白质结构中提取样式，完全绕过了折叠过程，就好像通过快进到最后一幕而不看前两个小时来解读一部电影。正如Rose等[ 4 ]最近在...
如今，以AlphaFold为代表的使用深度学习人工智能（AI）的蛋白质结构预测方法，可以于几秒钟内完成在原子分辨率的蛋白质结构预测[1]。目前，几乎地球上所有已知的蛋白质结构都已被预测，生命科学的研究似乎已进入"后AlphaFold时代"。AlphaFold的发展给生命科学带来了新的可能，...
2023-08-22
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【科海拾贝】因为"太交叉"找不到审稿人？中国学者跨界研究解决经典难题
去年年底，中国科生物物理研究所研究员胡俊杰团队把一篇论文投稿到《自然-通讯》杂志。"胡俊杰对《中国科学报》说， "但很少有人注意到，每个细胞只有一张内质网，所有的内质网结构，不管看起来是粗面片状的，还是光面管状的，全都是'联通'的，事实上就是一张网- -就像长命...
文 | 《中国科学报》记者 李晨阳去年年底，中国科生物物理研究所研究员胡俊杰团队把一篇论文投稿到《自然-通讯》杂志。没想到，杂志编辑被"难"住了。"我很难为这篇论文找到合适的审稿人。"编辑坦言，"因为这项研究太跨学科，太交叉了。"幸运的是，尽管最后只找到2位审稿人...
2023-06-13
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【科海拾贝】这篇Nature论文曾被Science拒稿，作者总结经验：捅破窗户纸！
近日，中国科生物物理研究所的3名“ 95后”博士生迎来了他们人生中的第一篇《自然》论文。3张年轻脸庞绽放的笑容，与一年前的沮丧形成了鲜明对比。”葛蔚然耐心地解释着， “我们这篇论文关注一个很著名的‘记号’ — —组蛋白H2A泛素化修饰，能够擦除它的‘橡皮’叫做PR-D...
文 | 《中国科学报》记者 李晨阳近日，中国科生物物理研究所的3名“95后”博士生迎来了他们人生中的第一篇《自然》论文。3张年轻脸庞绽放的笑容，与一年前的沮丧形成了鲜明对比。3名“95”后共同一作（从左至右：李晶晶、余聪、葛蔚然） 受访者供图（下同）当时这篇论文刚...
2023-05-31
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【IBP科普报道】驱动蛋白--细胞里穿行的纳米"火车"
你听说过驱动蛋白吗？前面提到驱动蛋白有一个承接货物的接口，不同的驱动蛋白有不同的接口，从而决定了它运输货物的种类。而细胞内的这些货物经常会结合多种货物接口，这样就造成了不同驱动蛋白工作的交叉重叠。有时候，它们还会像接力赛跑的运动员那样，将货物进行"交接" ，一...
你听说过驱动蛋白吗？这是一类体积微小，但是功能强大的ATP酶。说它体积微小，是因为典型的驱动蛋白只有几十纳米，相当于头发丝直径的千分之一。而说它功能强大，是因为在我们的身体里有上亿个这样的蛋白质，它们通过水解ATP发生动力，穿行在细胞里的微管轨道上，把各种营养、...
2023-04-18
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【科海拾贝】大四时被“忽悠”进组，27岁小伙发首篇Nature论文
5年前的夏天，中科院生物物理所园区回荡着悠长的蝉鸣。刘昊走进柳振峰研究员的办公室，当时他22岁，正在读大四，想要到柳老师的实验室里实习。近日， 27岁的刘昊以第一作者身份在国际顶级学术期刊Nature上发表了相关论文，解析了叶绿体蛋白质传送器的组装原理。叶绿体中的蛋白...
文 ｜ 《中国科学报》记者 李晨阳 见习记者 孟凌霄5年前的夏天，中科院生物物理所园区回荡着悠长的蝉鸣。刘昊走进柳振峰研究员的办公室，当时他22岁，正在读大四，想要到柳老师的实验室里实习。柳振峰在电脑上打开一张PPT，这是植物光合作用的分子机制图。在植物细胞中，叶绿...
2023-03-30
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【IBP科普报道】巧妙的设计：疱疹病毒的组装与释放
疱疹病毒是一类具有囊膜的双链DNA病毒，能够感染包括人类在内的几乎所有脊椎动物及部分无脊椎动物。疱疹病毒主要感染皮肤、黏膜和神经等组织，引发感染部位发生多种疾病，严重威胁人类和其他动物的健康。目前已经发现9种能够感染人类的疱疹病毒，造成单纯疱疹与生殖器疱疹（ HS...
疱疹病毒是一类具有囊膜的双链DNA病毒，能够感染包括人类在内的几乎所有脊椎动物及部分无脊椎动物。疱疹病毒主要感染皮肤、黏膜和神经等组织，引发感染部位发生多种疾病，严重威胁人类和其他动物的健康。目前已经发现9种能够感染人类的疱疹病毒，造成单纯疱疹与生殖器疱疹（HSV...
2023-02-24
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【IBP科普报道】分子拟态--病毒"狡猾"的伪装机制
一、什么是染色质？在正常情况下，宿主细胞通过DNA甲基化、组蛋白修饰、组蛋白变体、染色质重塑，以及非编码RNA等调控因子来改变染色质动态[ 3 ] 。能够模拟DNA的分子可以起到组蛋白伴侣的作用，通过占据组蛋白上的DNA结合位点调控其DNA结合活性，从而影响染色质的动态[ 13 ] ...
一、什么是染色质？什么是核小体？染色质是人类遗传物质DNA的载体，是维持人类基因组完整性和稳定性的物质基础。核小体是染色质的基本结构单元，是由多种组蛋白、DNA以及表观遗传标记组成的高度动态的结构单元[1]。从结构上看，核小体拥有一个直径 ~11 nm，厚度 ~5.5 nm 的盘状...
2023-01-31
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【IBP科普报道】免疫治疗--肿瘤治疗的 “新星”
2012年， 6岁的美国小女孩Emily在急性淋巴性白血病两次复发濒临死亡时，接受了当时尚未批准的CAR-T治疗。两周之后， Emily体内的癌细胞完全消失，至今Emily已经无癌健康生活了10年。针对细胞因子应用中的关键问题，傅阳心和彭华课题组近些年来深耕细胞因子领域，创造性地提出了...
2012年，6岁的美国小女孩Emily在急性淋巴性白血病两次复发濒临死亡时，接受了当时尚未批准的CAR-T治疗。两周之后，Emily体内的癌细胞完全消失，至今Emily已经无癌健康生活了10年。2018年10月1日，诺贝尔生理医学奖被授予美国科学家詹姆斯·艾利森（James P．Allison）和日本科...
2022-12-30
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